Số đàn đã tăng từ 28 đến hơn 165 giữa năm 1968 và 1997 và chăn thả quá mức ảnh hưởng tiêu cực đến môi trường sống. Để quản lý số lượng dân số, lâu dài, tránh thai không có nội tiết tố đã được sử dụng, chứng minh 95 phần trăm hiệu quả trên một thử nghiệm bảy năm.Các biện pháp tránh thai, mà bắt đầu được sử dụng ở một mức độ quản lý trong năm 1995 mặc dù nó đã được sử dụng một lượng nhỏ vào đầu năm 1989, cũng đã được chứng minh có hiệu quả cải thiện sức khỏe và tăng tuổi thọ của ngựa già thông qua việc loại bỏ thai và cho con bú căng thẳng liên quan đến nó. Kể từ năm 1990, sức khỏe đàn gia súc nói chung đã được cải thiện, tỷ lệ tử vong sớm đã giảm và ngựa cũ nay được tìm thấy, với nhiều độ tuổi trên 20 và một số thậm chí còn hơn 25.

Không có con ngựa đã từng bị thương trong quá trình điều trị phi tiêu của địa phương, mặc dù có một tỷ lệ 0,2 phần trăm của áp-xe tại chỗ tiêm, thường lành trong vòng hai tuần. Mỗi ngựa nái từ hai đến bốn tuổi được đưa ra biện pháp tránh thai, và điều trị sau đó được rút ra khi tạo ra một con non. Một khi nó đã sinh đủ số ngựa con được đại diệndi truyền trong đàn, thì nó được đặt trên một kế hoạch điều trị hàng năm cho đến khi cái chết.

Sau khi du nhập và áp dụng các biện pháp tránh thai, số đàn tiếp tục tăng lên mức cao nhất trong 175 năm 2001 lên năm 2005, nhưng sau đó đã giảm đáng kể xuống còn khoảng 130 trong năm 2009. Trong năm 2009, một nghiên cứu xác định rằng sự đa dạng DNA ty thể trong đàn là khá thấp, rất có thể do bị cô lập, nhưng sự đa dạng di truyền hạt nhân vẫn ở mức tương tự như của giống từ đất liền. Nhìn chung chúng vẫn có tiềm năng về gene.

Khác với các biện pháp tránh thai và điều trị trong trường hợp khẩn cấp, ngựa từ đàn Maryland được đối xử giống như động vật hoang dã khác, không có thêm sự chú ý trả tiền bởi nhân viên Dịch vụ công viên. Nó được cho là có khả năng đàn Maryland mang ngựa thiếu máu truyền nhiễm (EIA); chúng được cách ly hiệu quả, tuy nhiên, bằng cách cho phép không cưỡi hoặc cắm trại với ngựa thuộc sở hữu tư nhân dọc theo bờ đại lục trong mùa côn trùng kéo dài từ giữa tháng mười. Do điều trị như động vật hoang dã, ngựa từ đàn Maryland rất hung hăng, và đã có báo cáo của họ làm rách lều và cắn, đá và gõ móng xuống du khách.

Năm 2010, sau khi tăng trong sự cố cắn, các dịch vụ Vườn quốc gia thực hiện các biện pháp mới để giáo dục du khách về những con ngựa. Những biện pháp này bao gồm các thông tin mới về an toàn trong tài liệu quảng cáo và đề nghị xem khoảng cách giữa các du khách và ngựa. Ngoài ra còn có một số mối nguy hiểm cho con ngựa từ các du khách con ngựa bị đau sau khi được cho ăn thức ăn không phù hợp của con người, và trung bình một con ngựa Maryland một năm bị giết chết bởi một chiếc xe hơi. Từ năm 1991 đã có một "Pony Patrol", nơi mà các tình nguyện viên trên xe đạp tuần tra đảo, giáo dục du khách về những con ngựa lùn.

Đàn Virginia, thường được gọi là đàn Chincoteague, được sở hữu và quản lý bởi Công ty tình nguyện. Cục Cá và Động vật hoang dã Hoa Kỳ (FWS) cho phép ngựa sống trên đảo Assateague theo giấy phép sử dụng chăn thả đặc biệt, cho phép khoảng 150 con ngựa trưởng thành ở Chincoteague National Wildlife Refuge. Ba mươi tới 45 ngựa con được sinh ra vào bầy Chincoteague mỗi năm. Được sử dụng để duy trì kích cỡ đàn vào khoảng 150 loài. Kể từ năm 1943, FWS đã được làm việc trên đảo để bảo vệ và những nỗ lực của họ đôi khi bị đe dọa đàn Chincoteague.

Do vị trí của hàng rào do FWS, đã làm giảm lượng đất có sẵn cho chăn thả bằng ngựa. Các hàng rào cũng ngăn cản chúng ra biển, nơi mà thường đi để thoát khỏi côn trùng cắn, bao gồm cả muỗi. Năm 1962, một số ngựa bị mắc kẹt trong một bao vây bởi nước cao và mất đi khi chúng đã được tiến ra biển trong một cơn bão. Không giống như đàn Maryland, ngựa ở bên Virginia của hòn đảo được rào lại từ đường để ngăn chặn tự động tai nạn và làm nản lòng du khách từ nuôi ngựa.

Trong những năm cuối thế kỷ 20, một số ngựa trước đây đã bán đấu giá được trả lại cho Đảo Assateague khi số dân bị đe dọa giảm xuống dưới con số mục tiêu do số lượng lớn các ca tử vong do bão hoặc các vấn đề khác. Từ năm 1990, những con ngựa từ Virginia đàn gia súc đã được làm tròn lên năm hai lần để điều trị thú y, bao gồm tẩy giun và tiêm phòng các bệnh như bệnh dại, uốn ván và viêm não. Ngoài ra, theo dõi liên tục và sơ cứu cơ bản cho bất kỳ thương nhẹ được thực hiện bởi một ủy ban của sở cứu hỏa. Sự can thiệp này là cần thiết vì nhiều người trong số các con ngựa sẽ được đưa vào quần thể ngựa nói chung thông qua đấu giá và mua hàng của người mua tư nhân.